武漢水上馬拉松由國家體育總局游泳運動管理中心、中國游泳協會、武漢市人民政府和湖北省體育局主辦，武漢市體育局、武漢東湖生態旅游風景區管委會、武漢旅游體育集團承辦，武漢市社會體育指導中心和武漢國際體育賽事管理有限公司共同執行。賽事設有10公里百人專業競技游和千人方隊健康游活動。